Estudio bioinformático del gen CRN8 en Phytophthora infestans causante de la enfermedad tizón tardío en plantas
Palabras clave:
Phytophthora infestans, CRN8, Proteinas Crinkler, OomicetosResumen
El oomycota Phytophthora infestans es un desafío a controlar, debido a que este patógeno posee la capacidad de ocasionarle enfermedades a los cultivos alimenticios ya que se considera un oomiceto fitopatógenos, por lo cual, hoy en día continúa dificultando la producción de cultivos y perjudicando los ecosistemas a escala mundial, esta serie de proceso de infección a los cultivos implica la secreción de proteínas efectoras por parte del patógeno como la CRN8, con la finalidad de manipular los procesos de las células vegetales y la captación de nutrientes para apoyar su crecimiento y proliferación. Por esta razón se llevó a cabo en este estudio el análisis mediante herramientas de biología computacional con el fin de avanzar más sobre la caracterización completa de esta secuencia. Se realizó el alineamiento de diversas secuencias genéticas de CRN8 así como también se realizó una comparación filogenética de estas. En la parte del análisis estructural se realizó el modelamiento de la estructura tridimensional de la proteína producto de este gen mediante el uso de herramientas de predicción de modelos proteicos basados en métodos predictivos por enhebrado y ab initio. Se encontró homología de nuestra proteína con modelos de enzimas de tipo transferasa al momento de realizar alineamientos con estructuras contenidas en el Banco de Datos de Proteínas (PDB). De igual manera se logró conseguir un dato importante como lo es el sitio de unión a ligando de la proteína evaluada, encontrando que la molécula S-adenosil-L-homocisteína fue la que mejor encajó en su sitio activo.
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